Στο ΕΚ "Αθηνά" εντάσσονται τα παρακάτω Ινστιτούτα :
- ΙΕΛ (Ινστιτούτο Επεξεργασίας του Λόγου) με Διευθυντή τον κ. Β. Κατσούρο, Διευθυντή Ερευνών
- ΙΝΒΙΣ (Ινστιτούτο Βιομηχανικών Συστημάτων) με Διευθυντή τον Χ. Στύλιο, Καθηγητή στο Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων
- ΙΠΣΥ (Ινστιτούτο Πληροφοριακών Συστημάτων) με Διευθυντή τον κ. Μ. Γαροφαλάκη, Καθηγητή στο Πολυτεχνείο Κρήτης
- ΙΡΟ (Ινστιτούτο Ρομποτικής) με Διευθυντή τον κ. Κ. Δανιηλίδη, Καθηγητή στον Πανεπιστήμιο Πενσυλβάνιας
Στο Κέντρο έχουν ιδρυθεί, και λειτουργούν στη Γενική Διεύθυνση, οι παρακάτω μονάδες :
- Μονάδα Ανάπτυξης Ελληνικών Τεχνολογικών Συνεργατικών Σχηματισμών (Corallia), με επιστημονικό υπεύθυνο τον κ. Β. Μακιό, ομότιμο Καθηγητή στο Πανεπιστήμιο Πατρών
- Μονάδα Διαστημικών Προγραμμάτων (ΜΟ.ΔΙΑ.Π.), με επιστημονικό υπεύθυνο τον κ. Ε. Σαρρή, Καθηγητή στο Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης
- Μονάδα Περιβαλλοντικών και Δικτυακών Τεχνολογιών και Εφαρμογών (ΠΕΔΙΤΕ), με επιστημονικό υπεύθυνο τον κ. Σ. Ραψομανίκη, Καθηγητή στο Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης
- Μονάδα Φαρμακοπληροφορικής, με επιστημονικό υπεύθυνο τον κ. Π. Μαχαίρα, ομότιμο Καθηγητή στο Εθνικό & Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
- Μονάδα Τεχνητής Νοημοσύνης "Αρχιμήδης", με επικεφαλή τον κ. Τ. Σελλή, πρώην καθηγητή στο Εθνικό Μετσόβειο Πολυτεχνείο
- Μονάδα Αειφόρου Ανάπτυξης, με επιστημονική υπεύθυνη την κ. Φ. Κουντούρη, Καθηγήτρια στο Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
- Μονάδα Καινοτομίας για τις Γυναίκες, με επικεφαλή την κ. Ε. Πετρά, Μηχανικός Η/Υ, M.Sc.
Διάρθωση Γενικής Διεύθυνσης:
Διάρθωση του Κέντρου:
