Το Yποέργο 2 αφορά κατά κύριο λόγο στις εφαρμογές των επιστημών και νέων τεχνολογιών στην κατανόηση, τεκμηρίωση, πιστοποίηση και προβολή του πολιτιστικού αποθέματος. Στόχος του είναι η συμβολή στη ανάδειξη, διαχείριση και εκμετάλλευση αυτού του αποθέματος μέσα από διαδικασίες που περιλαμβάνουν τόσο παραδοσιακές μεθόδους (αρχαιολογική μελέτη) όσο και σύγχρονες εφαρμογές των υπολογιστικών επιστημών και της πληροφορικής. Το Υποέργο καλύπτει τον πυρήνα των ερευνητικών δραστηριοτήτων και τεχνογνωσίας του Ινστιτούτου στο πεδίο των Πολιτιστικών Επιστημών και περιλαμβάνει δράσεις δικτύωσης, προβολής και δημοσιοποίησης των ερευνητικών του αποτελεσμάτων.